+7 495 215-08-03

Новости

ЕМС и АУ РАН будут сотрудничать.

Они договорились совместно создать удобную облачную платформу, она будет применяться в клинической медицине и поможет анализировать геномные данные. Благодаря ей, станет возможным выявление гибридных генов, которые являются главными виновниками появления злокачественных опухолей, то есть, будет легче диагностировать онкологические заболевания.  Ее основой станут программные продукты, над которыми работают специалисты из АУ РАН. Это геномный ассемблер, создаваемый под руководством ведущего мирового специалиста по вычислительной биологии и биоинформатике, Павла Певзнера.Эти программы помогут объединить разрозненные данные получаемые после РНК секвенирований, производимых на популярных платформах Illumina и IonTorrent. Качество транскрипторных сборок создаваемых программами должно совпадать с результатами, полученными из лучших РНК сборщиков. Программа будет управляться через командную строку, поэтому ее будет удобно практически использовать.
Программа Кваст поможет оценить качество транскрипторных сборок, создаваемых ассемблерами и сравнить их. Она сможет работать, имея референсный геном, или без него. Оценки будут систематизироваться в таблицы, для всех сборок будут даны характеристики и графически отображено сравнение.  В центре исследований ЕМС будет подготовлена облачная инфраструктура, которая поможет хранить генетические данные и будет выполнять биоинформатические вычисления, необходимые для их анализа.В компании рассчитывают, что проект будет очень широко применяться в медицине.  В Академии наук уверены, что капитализация рынка исследований рака на ранней стадии огромна, и, если будет создан понятный, производительный с удобным интерфейсом продукт, это будет огромным шагом вперед, поэтому сотрудничество должно стать эффективным и взаимовыгодным.    
Вернуться к списку новостей →